MCC-Vlaanderen is een vereniging zonder winstoogmerk, waarvan de bestuursorganen paritair zijn samengesteld uit vertegenwoordigers van de melkproductiesector ( de melkveehouders ) enerzijds en de zuivelindustrie  ( de kopers ) anderzijds.

In de Algemene Vergadering  (AV) zetelen 56 personen.

• De Vlaamse melkproducenten zijn vertegenwoordigd door 28 personen. De kandidaten worden voorgedragen door de landbouworganisaties vertegenwoordigd in de Nationale Landbouwraad en door Dierengezondheidszorg Vlaanderen (DGZ) en de Vlaamse Rundveeteeltvereniging (VRV).
• De zuivelfabrieken, kopers van rauwe melk in Vlaanderen, zijn eveneens vertegenwoordigd door 28 personen. Deze mandaten worden proportioneel verdeeld in functie van het volume opgehaalde melk in Vlaanderen.

De Raad van Bestuur (RVB) bestaat uit 12 leden.

• Uit de AV worden door de landbouworganisaties 4 leden aangeduid, aangevuld met telkens 1 lid namens DGZ en VRV.
• Uit de AV worden voor de zuivelindustrie respectievelijk 3 leden namens de coöperaties en de private sector voorgedragen.

De Raad van Bestuur is vanaf 26 maart 2010 als volgt samengesteld :

•  Achten François, Voorzitter                                    Producent ( landbouworganisaties )
•  Desmet Christian, Ondervoorzitter                       Producent ( landbouworganisaties )
•  Vanhengel Paul, Ondervoorzitter                           Zuivelindustrie ( Campina )
•  Leloup Eddy                                                                 Zuivelindustrie ( Milcobel )
•  Van den Haute Hendrik                                             Producent ( landbouworganisaties )
•  Ryckaert Dirk                                                              Producent ( VRV )
•  Seghers Jules                                                             Zuivelindustrie ( Campina )
•  Van der Meulen Katrien                                            Producent ( landbouworganisaties )
•  Heylen Marcel                                                             Producent ( DGZ )
•  Henuset Stefaan                                                         Zuivelindustrie ( Olympia )
•  Verschoren Stefaan                                                  Zuivelindustrie ( Milcobel )
•  Voet Isabel                                                                   Zuivelindustrie ( Milcobel )

Adviseurs :  Cantaert Vera ( FAVV ), Van Ginderachter Noël (Vlaamse overheid),   Vanrobaeys Mia ( DGZ ) en Verstraeten Hugo ( VRV ).
Directeur : De Meulemeester Luc
Secretaris : Ceulemans Hilda

De agenda van de RVB wordt voorbereid door het Bestuurscomité waarvan de bestuursleden  François Achten, Christian Desmet, Eddy Leloup, Paul Vanhengel en de  directeur Luc De Meulemeester deel uitmaken.

De werking van MCC en de toepassing van de melkkwaliteitsreglementering in het algemeen wordt bovendien toegelicht in de Technische Comités Producenten en Zuivelindustrie. Deze beide comités hebben een adviserende rol.